गंगोत्री मंदिर उत्तराखण्ड के प्रसिद्ध मंदिरों में से एक है। यह भागीरथी नदी के तट पर स्थित है। ये मंदिर भारी बर्फबारी की वजह से सर्दियों के दौरान बंद रहता है। इस मंदिर के पास स्थित आश्रम पर्यटकों के लिए आवास की सुविधा प्रदान करता है।
जब भागीरथ गंगा को स्वर्ग से लेकर आये थे। तो यहीं पर भगवान शिव ने उन्हें जटाओं में बांधकर जमीन पर उतारा था। वर्तमान में यहाँ पर स्थित ये मंदिर एक गोरखा जनरल अमर सिंह थापा द्वारा 18 वीं सदी में बनवाया गया था। अठांरवीं सदी में बना यह मंदिर सफ़ेद ग्रेनाइट से बना हुआ है।
